PHASiFY ENRICH cfDNA 提取试剂盒
PHASiFY ENRICH cfDNA 提取试剂盒旨在从血浆中提取最多的 cfDNA 产量,并通过筛选核酸片段大小提升 目标cfDNA 的富集能力
- 仅供研究之用
产品性能
- 高产量/高浓度:灵活的洗脱体积能够使游离 核酸的回收量提高数倍
- 高纯度:去除污染的基因组 DNA,同时不损失目标 cfDNA
- 通过筛选核酸片段大小进行富集:去除 >500 bp 的高分子量 DNA
- 可调整筛选的核酸片段大小:联系我们讨论定制化解决方案
产品规格
应用 | ddPCR, PCR, real-time PCR, NGS, 及其他 | |
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样本类型 | 血浆 | |
操作时长 | ~210分钟 | |
输入样本量 | 1 mL, 2 mL | |
洗脱体积 | 5 µL - 150µL | |
保质期稳定性 | 12 个月 | |
产品用途 | 仅供科研使用 | |
操作 | 手动 | |
运输条件 | 室温 | |
储存条件 | 常温产品盒:储存在 15-30°C 冷藏盒:储存在 4°C |
图 1 - 提高循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的产量
使用 PHASiFY ENRICH 和 QIAamp CNA 试剂盒从 28 个组织活检阳性的癌症患者血浆样本(1 mL)中提取 cfDNA。与 QIAamp CNA 相比,PHASiFY ENRICH 的突变拷贝回收量平均提高了 2.5 倍(P 值 <0.01 Wilcoxon Signed-Rank)。
图 2 – 富集cfDNA 片段以及去除污染基因组 DNA
从在2 mL的 健康人血浆中加入 100 bp 的DNA ladder,使用 PHASiFY MAX 和 PHASiFY ENRICH从以上样本中提取 DNA。片段分析仪的迹线显示大幅去除了500 bp 以上的片段,同时保留了目标 cfDNA 的回收。
常见问题
如果血浆输入量少于试剂盒上标明的体积,我们建议在操作步骤1之前,先添加 1x PBS (pH 7.4) 使样品体积达到指示体积。但是,我们不建议使用浓度低于 80% v/v 的血浆。
过高样本输入体积可能会破坏相位形成。我们建议使用试剂盒上标明的血浆输入体积。
在可控的条件下,使用1 mL 血浆输入试剂盒大约可以得到800-860 μL的下相溶液;使用2 mL 血浆输入试剂盒大约可以得到900-950 μL的下相溶液,无论多少,我们建议在步骤 5 中将所有下相溶液全部提取。
这将取决于您提取的 DNA 的下游应用。有可能任何错误液相的转移都会影响您的检测结果。对于大部分下游检测应用,我们发现转移少量(<10% 体积)错误液相不会对检测结果产生明显的影响。但是,在第 7 步中如果转移过多的下相溶液会影响片段大小的筛选结果。
我们建议在所有情况下都避免转移错误的液相溶液。
我们建议仅转移规定数量的红色上相溶液。转移过多的上相溶液可能会影响片段尺寸筛选的结果,不能很好地去除不良的大片段。我们建议您提取规定体积的上相溶液。
您可以在 使用70%的乙醇洗脱 之前,先加入 40% 异丙醇进行洗脱(即重复步骤 15 和 16)以增加样本的纯度。请注意,额外的洗脱步骤可能会降低 DNA 回收率/产量。
PHASiFY ENRICH 试剂盒可逐步去除从 500bp 到 1000bp 的 DNA 片段,并且可以完全去除1000bp以上的片段。主要收集 cfDNA 单体、二聚体和三聚体片段。
PHASiFY ENRICH 试剂盒可以完全去除大于 1000 bp 的 DNA片段,这些可能是基因组 DNA被 释放到血浆中引起的。该产品还可以去除其他常见污染物比如蛋白质。
经测试,PHASiFY ENRICH的cfDNA 回收量和 PHASiFY MAX 相当。 PHASiFY MAX 旨在收集尽可能多的 DNA,而 PHASiFY ENRICH
旨在去除血浆样本中的大片段 DNA。