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PHASiFY ENRICH cfDNA 提取试剂盒

PHASiFY ENRICH cfDNA 提取试剂盒

PHASiFY ENRICH cfDNA 提取试剂盒旨在从血浆中提取最多的 cfDNA 产量,并通过筛选核酸片段大小提升 目标cfDNA 的富集能力

  • 仅供研究之用
PHASiFY ENRICH cfDNA 提取试剂盒

产品性能

 

  • 高产量/高浓度:灵活的洗脱体积能够使游离 核酸的回收量提高数倍
  • 高纯度:去除污染的基因组 DNA,同时不损失目标 cfDNA
  • 通过筛选核酸片段大小进行富集:去除 >500 bp 的高分子量 DNA
  • 可调整筛选的核酸片段大小:联系我们讨论定制化解决方案
 
 

 

产品规格

 

应用ddPCR, PCR, real-time PCR, NGS, 及其他 
样本类型 血浆
操作时长 ~210分钟
输入样本量1 mL, 2 mL  
洗脱体积5 µL - 150µL 
保质期稳定性12 个月 
产品用途 仅供科研使用
操作手动
运输条件室温
储存条件

常温产品盒:储存在 15-30°C 

冷藏盒:储存在 4°C 

 

 

 

 

Chart, box and whisker chartDescription automatically generated

图 1 - 提高循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的产量 

 

使用 PHASiFY ENRICH 和 QIAamp CNA 试剂盒从 28 个组织活检阳性的癌症患者血浆样本(1 mL)中提取 cfDNA。与 QIAamp CNA 相比,PHASiFY ENRICH 的突变拷贝回收量平均提高了 2.5 倍(P 值 <0.01 Wilcoxon Signed-Rank)。

 

 

 

A picture containing chartDescription automatically generated

图 2 – 富集cfDNA 片段以及去除污染基因组 DNA 

 

从在2 mL的 健康人血浆中加入 100 bp 的DNA ladder,使用 PHASiFY MAX 和 PHASiFY ENRICH从以上样本中提取 DNA。片段分析仪的迹线显示大幅去除了500 bp 以上的片段,同时保留了目标 cfDNA 的回收。

 

常见问题

 

 

如果血浆输入量少于试剂盒上标明的体积,我们建议在操作步骤1之前,先添加 1x PBS (pH 7.4) 使样品体积达到指示体积。但是,我们不建议使用浓度低于 80% v/v 的血浆。

过高样本输入体积可能会破坏相位形成。我们建议使用试剂盒上标明的血浆输入体积。

在可控的条件下,使用1 mL 血浆输入试剂盒大约可以得到800-860 μL的下相溶液;使用2 mL 血浆输入试剂盒大约可以得到900-950 μL的下相溶液,无论多少,我们建议在步骤 5 中将所有下相溶液全部提取。

这将取决于您提取的 DNA 的下游应用。有可能任何错误液相的转移都会影响您的检测结果。对于大部分下游检测应用,我们发现转移少量(<10% 体积)错误液相不会对检测结果产生明显的影响。但是,在第 7 步中如果转移过多的下相溶液会影响片段大小的筛选结果。


我们建议在所有情况下都避免转移错误的液相溶液。

我们建议仅转移规定数量的红色上相溶液。转移过多的上相溶液可能会影响片段尺寸筛选的结果,不能很好地去除不良的大片段。我们建议您提取规定体积的上相溶液。

您可以在 使用70%的乙醇洗脱 之前,先加入 40% 异丙醇进行洗脱(即重复步骤 15 和 16)以增加样本的纯度。请注意,额外的洗脱步骤可能会降低 DNA 回收率/产量。

 

PHASiFY ENRICH 试剂盒可逐步去除从 500bp 到 1000bp 的 DNA 片段,并且可以完全去除1000bp以上的片段。主要收集 cfDNA 单体、二聚体和三聚体片段。

 

PHASiFY ENRICH 试剂盒可以完全去除大于 1000 bp 的 DNA片段,这些可能是基因组 DNA被 释放到血浆中引起的。该产品还可以去除其他常见污染物比如蛋白质。

 

经测试,PHASiFY ENRICH的cfDNA 回收量和 PHASiFY MAX 相当。 PHASiFY MAX 旨在收集尽可能多的 DNA,而 PHASiFY ENRICH
旨在去除血浆样本中的大片段 DNA。