PHASiFY ENRICH cfDNA 提取试剂盒
PHASiFY ENRICH cfDNA 提取試劑盒旨在從血漿中提取最多的 cfDNA 產量，並通過篩選核酸片段大小提升 目標cfDNA 的富集能力
- 僅供研究之用
產品性能
- 高產量/高濃度：靈活的洗脫體積能夠使游離 核酸的回收量提高數倍
- 高純度：去除污染的基因組 DNA，同時不損失目標 cfDNA
- 通過篩選核酸片段大小進行富集：去除 >500 bp 的高分子量 DNA
- 可調整篩選的核酸片段大小：聯繫我們討論定制化解決方案
產品規格
| 應用 | ddPCR, PCR, real-time PCR, NGS, 及其他 | |
|---|---|---|
| 樣本類型 | 血漿 | |
| 操作時長 | ~210分鐘 | |
| 輸入樣本量 | 1 mL, 2 mL | |
| 洗脫體積 | 5 µL - 150µL | |
| 保質期穩定性 | 12 個月 | |
| 產品用途 | 僅供科研使用 | |
| 操作 | 手動 | |
| 運輸條件 | 室溫 | |
| 儲存條件 | 常溫產品盒：儲存在 15-30°C 冷藏盒：儲存在 4°C |
圖 1 - 提高循環腫瘤 DNA (ctDNA) 的產量
使用 PHASiFY ENRICH 和 QIAamp CNA 試劑盒從 28 個組織活檢陽性的癌症患者血漿樣本（1 mL）中提取 cfDNA。與 QIAamp CNA 相比，PHASiFY ENRICH 的突變拷貝回收量平均提高了 2.5 倍（P 值 <0.01 Wilcoxon Signed-Rank）。
圖 2 – 富集cfDNA 片段以及去除污染基因組 DNA
從在2 mL的 健康人血漿中加入 100 bp 的DNA ladder，使用 PHASiFY MAX 和 PHASiFY ENRICH從以上樣本中提取 DNA。片段分析儀的跡線顯示大幅去除了500 bp 以上的片段，同時保留了目標 cfDNA 的回收。
常見問題
如果血漿輸入量少於試劑盒上標明的體積，我們建議在操作步驟1之前，先添加 1x PBS (pH 7.4) 使樣品體積達到指示體積。但是，我們不建議使用濃度低於 80% v/v 的血漿。
過高樣本輸入體積可能會破壞相位形成。我們建議使用試劑盒上標明的血漿輸入體積。
在可控的條件下，使用1 mL 血漿輸入試劑盒大約可以得到800-860 μL的下相溶液；使用2 mL 血漿輸入試劑盒大約可以得到900-950 μL的下相溶液，無論多少，我們建議在步驟 5 中將所有下相溶液全部提取。
這將取決於您提取的 DNA 的下游應用。有可能任何錯誤液相的轉移都會影響您的檢測結果。對於大部分下游檢測應用，我們發現轉移少量（<10% 體積）錯誤液相不會對檢測結果產生明顯的影響。但是，在第 7 步中如果轉移過多的下相溶液會影響片段大小的篩選結果。
我們建議在所有情況下都避免轉移錯誤的液相溶液。
我們建議僅轉移規定數量的紅色上相溶液。轉移過多的上相溶液可能會影響片段尺寸篩選的結果，不能很好地去除不良的大片段。我們建議您提取規定體積的上相溶液。
您可以在 使用70%的乙醇洗脫 之前，先加入 40% 異丙醇進行洗脫（即重複步驟 15 和 16）以增加樣本的純度。請注意，額外的洗脫步驟可能會降低 DNA 回收率/產量。
PHASiFY ENRICH 試劑盒可逐步去除從 500bp 到 1000bp 的 DNA 片段，並且可以完全去除1000bp以上的片段。主要收集 cfDNA 單體、二聚體和三聚體片段。
PHASiFY ENRICH 試劑盒可以完全去除大於 1000 bp 的 DNA片段，這些可能是基因組 DNA被 釋放到血漿中引起的。該產品還可以去除其他常見污染物比如蛋白質。
經測試，PHASiFY ENRICH的cfDNA 回收量和 PHASiFY MAX 相當。 PHASiFY MAX 旨在收集盡可能多的 DNA，而 PHASiFY ENRICH
旨在去除血漿樣本中的大片段 DNA。
